Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtnP63089 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtnP63089 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtnP63089 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtnP63089 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtnP63089 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms