Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2lP62876 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2lP62876 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms