Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms