Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms