Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta2P62737 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta2P62737 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms