Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl18aP62717 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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