Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms