Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms