Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2kP61087 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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