Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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