Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap25P60879 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap25P60879 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap25P60879 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms