Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp4P59240 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms