Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms