Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dpf3P58269 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms