Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmoP56726 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmoP56726 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmoP56726 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms