Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5bP56480 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms