Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms