Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ephb4P54761 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb4P54761 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms