Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad23aP54726 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms