Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HccsP53702 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms