Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RabggtbP53612 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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