Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Map3k1P53349 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms