Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lbx1P52955 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms