Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp1P52624 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp1P52624 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms