Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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