Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntfP51642 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntfP51642 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CntfP51642 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms