Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TspoP50637 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TspoP50637 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TspoP50637 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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