Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms