Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psen1P49769 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms