Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp3P49194 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms