Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms