Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms