Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfx2P48379 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfx2P48379 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms