Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VdrP48281 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VdrP48281 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VdrP48281 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VdrP48281 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VdrP48281 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VdrP48281 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms