Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41P48193 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41P48193 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms