Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CratP47934 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CratP47934 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CratP47934 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CratP47934 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CratP47934 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms