Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms