Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms