Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3aP47708 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms