Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf1P46099 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf1P46099 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms