Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx2P43241 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx2P43241 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms