Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx1-2P42580 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx1-2P42580 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms