Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3rP40223 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms