Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf2P39429 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms