Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik2P39087 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik2P39087 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms