Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Col18a1P39061 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col18a1P39061 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms