Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpargP37238 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpargP37238 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpargP37238 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms