Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprkP35822 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms