Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptpn1P35821 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms