Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpardP35396 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpardP35396 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpardP35396 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpardP35396 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpardP35396 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpardP35396 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms